Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifitm3Q9CQW9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifitm3Q9CQW9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms