Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp5f1Q9CQQ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms