Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQ90 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQ90 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms