Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubl4bQ9CQ84 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ubl4bQ9CQ84 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Ubl4bQ9CQ84 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms