Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms