Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim12aQ99PQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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