Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rrbp1Q99PL5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rrbp1Q99PL5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rrbp1Q99PL5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms