Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ms4a4dQ99N05 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a4dQ99N05 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms