Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd1Q99MV1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tdrd1Q99MV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tdrd1Q99MV1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms