Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epdr1Q99M71 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epdr1Q99M71 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms