Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms