Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EpcamQ99JW5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms