Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clstn3Q99JH7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clstn3Q99JH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms