Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Derl1Q99J56 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Derl1Q99J56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Derl1Q99J56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms