Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrbp1Q99J45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrbp1Q99J45 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrbp1Q99J45 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms