Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smim11aQ99J19 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Smim11aQ99J19 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Smim11aQ99J19 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms