Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtpbp3Q923K4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtpbp3Q923K4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp3Q923K4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp3Q923K4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp3Q923K4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtpbp3Q923K4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp3Q923K4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtpbp3Q923K4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms