Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubb6Q922F4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb6Q922F4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms