Protein–RNA interactions for Protein: Q920A5

Scpep1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scpep1Q920A5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scpep1Q920A5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scpep1Q920A5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms