Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarca5Q91ZW3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarca5Q91ZW3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarca5Q91ZW3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms