Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cts3Q91ZD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cts3Q91ZD5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms