Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx4Q91YJ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx4Q91YJ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms