Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdha12Q91Y18 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdha12Q91Y18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha12Q91Y18 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms