Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Basp1Q91XV3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Basp1Q91XV3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Basp1Q91XV3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms