Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Creb3l3Q91XE9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Creb3l3Q91XE9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Creb3l3Q91XE9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Creb3l3Q91XE9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms