Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD2

Trpv6, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv6Q91WD2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trpv6Q91WD2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpv6Q91WD2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms