Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp3Q91W36 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp3Q91W36 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Usp3Q91W36 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms