Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd248Q91V98 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd248Q91V98 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms