Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacng8Q8VHW2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms