Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppargc1bQ8VHJ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms