Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SelenomQ8VHC3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelenomQ8VHC3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelenomQ8VHC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms