Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgbl1Q8VDV0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgbl1Q8VDV0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgbl1Q8VDV0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms