Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RfxapQ8VCG9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms