Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VCE4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8VCE4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VCE4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VCE4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VCE4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.8 ms