Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4cQ8VCD7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4cQ8VCD7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms