Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BbxQ8VBW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms