Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ApobrQ8VBT6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ApobrQ8VBT6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms