Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup35Q8R4R6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms