Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp3Q8R4B8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp3Q8R4B8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms