Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sumf1Q8R0F3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms