Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b4Q8QZY9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b4Q8QZY9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms