Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OptnQ8K3K8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OptnQ8K3K8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OptnQ8K3K8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms