Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MyripQ8K3I4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MyripQ8K3I4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms