Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ncapd2Q8K2Z4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms