Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rell1Q8K2J7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rell1Q8K2J7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rell1Q8K2J7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms