Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brd3Q8K2F0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd3Q8K2F0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms