Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gin1Q8K259 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gin1Q8K259 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gin1Q8K259 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms