Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil3Q8K203 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms