Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek9Q8K1R7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms