Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D2

Habp2, Hyaluronan-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp2Q8K0D2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp2Q8K0D2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp2Q8K0D2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp2Q8K0D2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Habp2Q8K0D2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Habp2Q8K0D2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms